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    中山鏡頭
    在基因芯片里“看見(jiàn)”病原體
    發(fā)布時(shí)間:2024-02-26 來(lái)源:中山日?qǐng)?bào)


       ▲通過(guò)特殊處理后肉眼能看到芯片上的探針矩陣。


       實(shí)驗(yàn)人員在處理樣本。


       公司自主研發(fā)的設(shè)備“全自動(dòng)核酸提取儀”可用于提取核酸。圖為實(shí)驗(yàn)人員將預(yù)處理完畢的樣本上機(jī)。


       手持基因芯片的背景是通過(guò)自主研發(fā)的設(shè)備“微陣列芯片掃描儀”,通過(guò)熒光紅綠點(diǎn)分析可得出數(shù)據(jù)。


       實(shí)驗(yàn)人員將加完樣本的芯片套放入雜交盒中,接下來(lái)將放進(jìn)核酸分子雜交儀進(jìn)行雜交。


       ▲蔡偉文對(duì)蝦塘土壤樣本的基因芯片檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行分析。


       ▲康源基因的基因芯片技術(shù)可以對(duì)17種病原體進(jìn)行檢測(cè)。


       ▲將基因芯片技術(shù)應(yīng)用于南美白對(duì)蝦養(yǎng)殖,塘頭實(shí)驗(yàn)效果超出預(yù)期。圖為收蝦現(xiàn)場(chǎng)。

    病毒是肉眼看不見(jiàn)的,但在基因芯片上,它們是可以“現(xiàn)形”的。2月上旬,記者走進(jìn)位于國(guó)家健康產(chǎn)業(yè)基地的中山康源基因技術(shù)科技有限公司(簡(jiǎn)稱(chēng)“康源基因”)的實(shí)驗(yàn)室,了解基因芯片是如何制作并進(jìn)行檢測(cè)的。

    康源基因是國(guó)內(nèi)首家原創(chuàng)基因芯片研發(fā)應(yīng)用高新企業(yè),于2014年底落戶(hù)中山,并在當(dāng)年獲得中山市“旋風(fēng)計(jì)劃”項(xiàng)目資助。公司的創(chuàng)辦人蔡偉文,是紐約大學(xué)生物分子化學(xué)博士,其從事生物分子學(xué)研究達(dá)30多年,最先開(kāi)發(fā)出徹底解決基因芯片非特異性表面熒光背景問(wèn)題的制備方法并獲得美國(guó)專(zhuān)利,同時(shí)也最先開(kāi)發(fā)出比較基因組雜交芯片技術(shù)(aCGH),并作為首批科學(xué)家參加了國(guó)際“人類(lèi)基因組計(jì)劃”。

    在康源基因的實(shí)驗(yàn)室,技術(shù)人員在對(duì)送來(lái)的樣本進(jìn)行檢測(cè)。據(jù)蔡偉文介紹,基因芯片就是將大量的探針?lè)肿庸潭ㄓ谥С治锷现谱鞫傻男酒=拥娇蛻?hù)的樣本后,技術(shù)人員先通過(guò)設(shè)備提取樣本的DNA,然后通過(guò)PCR擴(kuò)增后,樣品分子按堿基配對(duì)的原理與芯片上的探針?lè)肿与s交,再通過(guò)檢測(cè)設(shè)備對(duì)其掃描,得到每種探針?lè)肿拥碾s交信號(hào)強(qiáng)度,通過(guò)相應(yīng)的軟件對(duì)信號(hào)進(jìn)行分析,就可以了解樣本的DNA序列信息,由此可以判斷樣本是否感染了病原體,并出具樣品檢測(cè)報(bào)告。

    康源基因的高特異性高靈敏度的基因芯片制造技術(shù)已經(jīng)獲得了國(guó)家發(fā)明專(zhuān)利。蔡偉文介紹,康源基因公司為該技術(shù)的研發(fā)和應(yīng)用投入了大量的人力和物力。目前,基因芯片技術(shù)可用于醫(yī)學(xué)領(lǐng)域、現(xiàn)代農(nóng)業(yè)領(lǐng)域、環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域、美妝領(lǐng)域等。

    在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,精準(zhǔn)而快速的檢測(cè)結(jié)果能為病人的治療甚至搶救贏得寶貴的時(shí)間。例如公司開(kāi)發(fā)的腸道微生態(tài)檢測(cè)芯片,可以區(qū)分2107種細(xì)菌種類(lèi),涵蓋了99%的人體腸道微生物范圍。相比傳統(tǒng)的第二代基因測(cè)序方法,所需要的樣本量(0.2-0.3克)少,檢測(cè)的細(xì)菌種類(lèi)多,數(shù)據(jù)完整,且檢測(cè)時(shí)間短,準(zhǔn)確率高,便于推廣。

    十年磨一劍,在實(shí)驗(yàn)室里,還有康源基因自主研發(fā)的各種設(shè)備。據(jù)介紹,目前,公司自主研發(fā)了便攜式生物基因檢測(cè)定量系統(tǒng)及全自動(dòng)核酸分子雜交儀、全自動(dòng)核酸提取儀、芯片掃描儀等配套設(shè)備,推動(dòng)基因芯片技術(shù)的普及和推廣。

    記者 黃啟艷  明劍  圖編 文波

    ◆編輯:龍慧◆二審:陳吉春◆三審:周亞平

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